Program Slovenski jezik v sinhronem in diahronem razvoju Trajanje programa: 1. januar 2009–31. december 2014 Šifra: P6-0038
Program Pogoji in problemi sodobne filozofije II Trajanje programa: 1. januar 2009–31. december 2014 Vodja programa: Alenka Zupančič
Program Umetnost na Slovenskem v stičišču kultur Trajanje programa: 1. januar 2009–31. december 2027 Vodja programa: izr. prof. dr. Mija Oter Gorenčič Šifra: P6-0061 (B)
Projekt Geomorfološka in speleogenetska analiza razvoja kraških oblik Dinarskega in Krimskega krasa Trajanje projekta: 1. januar 2009–31. december 2010 Vodja projekta: dr. Andrej Mihevc Šifra: BI-UA/09-10-010
Projekt Študij viabilnosti ameb in način njihovega prenosa v okolju: primer iz kraških jam Trajanje projekta: 1. januar 2009–31. december 2010 Šifra: BI-AT/09-10-023
Projekt Kraški sedimenti: orodje za rekonstrukcijo tektonskega in geomorfnega razvoja kraških področij (na zgledih s kraških ozemelj Slovenije) Trajanje projekta: 1. januar 2009–31. december 2010 Vodja projekta: Nadja Zupan Hajna Šifra: BI-UA/09-10-010
Program Naravna in kulturna dediščina Trajanje programa: 1. januar 2009–31. december 2014 Vodja programa: dr. Jerneja Fridl Šifra: IO-0031
Projekt Konstruiranje pajčje mreže preko madagaskarskih rek: nenavadna pajčevina gigantskih mrež Trajanje projekta: 1. januar 2009–31. december 2010 Šifra: 8655-09
Program Jezik, spomin in politike reprezentacije Trajanje programa: 1. januar 2009–31. december 2012 Šifra: P6-0347
Projekt Preoblikovanje vzhodnih mej v Evropi: mreža raziskovanja družbenih, moralnih in materialnih re-lokacij evropskih vzhodnih periferij Trajanje projekta: 1. januar 2009–1. januar 2013 Vodja projekta: dr. Sarah Green Šifra: Eastbordnet