Projekt Antropološka analiza izbranih antičnih arheoloških najdišč Slovenije Trajanje projekta: 1. september 2005–31. avgust 2008 Vodja projekta: dr. Petra Leben-Seljak Šifra: J6-7590
Projekt Raziskave nosilcev ljudsko-kulturnih pojavov Trajanje projekta: 1. september 2005–31. avgust 2008 Šifra: J6-7005
Projekt Filogenija pajkov iz družine Nephilidae kot test antagonistične koevolucije spolov Trajanje projekta: 1. september 2005–31. avgust 2007 Šifra: Z1-7082-0618-05
Projekt Odlagališča odpadkov v Ljubljani Trajanje projekta: 1. junij 2005–30. september 2006 Vodja projekta: dr. Aleš Smrekar
Projekt Ekološke raziskave evropskih ogroženih vrst metuljev (Lepidoptera) v Sloveniji in na Madžarskem, s poudarkom na vrstah iz seznama NATURA 2000 Trajanje projekta: 3. januar 2005–20. december 2006
Projekt Taksonomske, horološke in fitocenološke raziskave skupin Hieracium villosum in H. bifidum (Compositae) v Češki republiki in Sloveniji Trajanje projekta: 3. januar 2005–20. december 2006 Šifra: BI-CZ/05-06/029
Projekt Zdrava H2O zame Trajanje projekta: 1. januar 2005–31. december 2005 Vodja projekta: dr. Aleš Smrekar
Projekt Rekonstrukcija paleookolja s pomočjo analize rastlinskih in živalskih mikrofosilov v kulturnih plasteh slovenskih arheoloških najdišč Trajanje projekta: 1. januar 2005–31. december 2007 Vodja projekta: Alexandra Golyeva Šifra: BI-RU/05-07-012
Projekt Learning Migration, Learning about Migration and Intercultural Relations in School and Teacher Training Trajanje projekta: 1. januar 2005–1. januar 2008