Projekt Center za arhitekturo Krasa Trajanje projekta: 1. april 2009–29. februar 2012 Vodja projekta: Aleksandra Torbica
Projekt Izvori in transformacije motivov in simbolov v literaturi in jezikih Trajanje projekta: 1. marec 2009–30. november 2012 Vodja projekta: Dr. Irena Avsenik Nabergoj Šifra: J6-2090
Projekt Preurejanje evropskih vzhodnih meja: raziskovalna mreža socialnih, moralnih in materialnih premestitev vzhodnoevropskih periferij Trajanje projekta: 15. januar 2009–14. januar 2013
Program Biografije, mentalitete, epohe 2009‒2014 Trajanje programa: 1. januar 2009–31. december 2014 Vodja programa: red. prof. ddr. Igor Grdina Šifra: P6-0094
Program Literarnozgodovinske, literarnoteoretične in metodološke raziskave Trajanje programa: 1. januar 2009–31. december 2014 Vodja programa: dr. Marko Juvan Šifra: P6–0024 (B)
Program Raziskave slovenske glasbene preteklosti Trajanje programa: 1. januar 2009–31. december 2014 Vodja programa: dr. Jurij Snoj Šifra: P6-0004
Program Pogoji in problemi sodobne filozofije II Trajanje programa: 1. januar 2009–31. december 2014 Vodja programa: Alenka Zupančič
Program Naravna in kulturna dediščina Trajanje programa: 1. januar 2009–31. december 2014 Vodja programa: dr. Jerneja Fridl Šifra: IO-0031
Projekt Konstruiranje pajčje mreže preko madagaskarskih rek: nenavadna pajčevina gigantskih mrež Trajanje projekta: 1. januar 2009–31. december 2010 Šifra: 8655-09
Projekt Kraški sedimenti: orodje za rekonstrukcijo tektonskega in geomorfnega razvoja kraških področij (na zgledih s kraških ozemelj Slovenije) Trajanje projekta: 1. januar 2009–31. december 2010 Šifra: BI-CZ/09-10-008