Zbirka vsebuje podatke o flori, rastlinskih združbah, favni (metuljih, hroščih idr.), njihovih lokacijah, rastišču, okoljskih parametrih, številu osebkov, spolu ipd. Obsežni so metapodatki, npr. geografski podatki (države, pokrajine, kraji, reke, vrhovi), ekološki podatki (habitatni tipi, sintaksoni, tipi tal, antropogeni vplivi, raba), podatki o vrstah (opisi, fotografije, sinonimi).
Izpis podatkov je v obliki kart po UTM ali srednjeevropskih kvadrantih ali natančnih lokacijah, kot preglednice, fitocenološke analitične ali sintetične tabele. Izvoz podatkov omogoča uporabo v aplikacijah GIS, urejevalnikih besedil, preglednicah, statističnih orodjih.
obsega geodetske posnetke in skice večinoma tistih arheoloških najdišč, kjer so raziskovali sodelavci Inštituta za arheologijo, pa tudi nekaj kopij iz drugih arhivov (npr. Pokrajinskega muzeja v Celju). Najstarejši dokument v našem fondu je kopija načrta iz leta 1916.
Popis tekoče muzikološke literature za Slovenijo poteka v sodelovanju z RILM (Répertoire international de littérature musicale) v New Yorku od leta 1984; leta 1991 je bila ustanovljena področna delovna skupina za Slovenijo, ki ima svoj sedež na Muzikološkem inštitutu.
Zbirka obsega podatke o zgodovinskih naravnih nesrečah v Sloveniji ter podatke o nevarnosti za najpogostejše tipe naravnih nesreč.
Povezava na Geografski atlas naravnih nesreč v Sloveniji.
Zbirka obsega arhivsko gradivo o Slovencih po svetu: gradivo, zbrano do konca leta 2005, je 23. 2. 2006 prevzel od ISIM v hrambo Arhiv Republike Slovenije. Popis ZBIRKE INŠTITUTA ZA SLOVENSKO IZSELJENSTVO IN MIGRACIJE ZRC SAZU v Arhivu Slovenije bo ISIM tudi v prihodnje dopolnjeval.