Program Literarnozgodovinske, literarnoteoretične in metodološke raziskave Trajanje programa: 1. januar 2004–31. december 2008 Vodja programa: dr. Darko Dolinar Šifra: P6-0024 (A)
Projekt Neznani rokopisi slovenskega slovstva 17. in 18. stoletja Trajanje projekta: 1. februar 2008–30. januar 2011 Vodja projekta: dr. Matija Ogrin Šifra: L6-0163 (B)
Projekt Elektronske znanstvenokritične izdaje in razvoj slovenske ter bolgarske literarne vede Trajanje projekta: 9. november 2011–9. november 2013 Vodja projekta: dr. Matija Ogrin Šifra: BI-BG/11-12-003
Projekt Trajnostni razvoj varovanih območij - celostni pristop in aktivna vloga države Trajanje projekta: 1. oktober 2006–30. september 2008 Vodja projekta: Dušan Plut Šifra: V5-0298
Projekt Islandski in slovenski kulturni svetniki Trajanje projekta: 29. september 2009–31. december 2010 Šifra: NFM-NFM-45/09
Projekt Primerjalne raziskave češkega in slovenskega literarnega polja v srednjeevropskem kontekstu Trajanje projekta: 1. januar 2007–31. december 2008 Šifra: BI-CZ/07-08-005
Projekt ACUME 2 – Vmesniki med eksaktnimi znanostmi, literaturo in humanistiko Trajanje projekta: 1. januar 2007–31. december 2010 Vodja projekta: Vita Fortunati
Projekt Za svobodo domovine. Fronta v Julijcih 1915-1917 Trajanje projekta: 1. junij 2006–31. maj 2008 Vodja projekta: dr. Petra Svoljšak Šifra: M6-0158
Projekt SENT – Mreža evropskih študij Trajanje projekta: 1. oktober 2007–30. junij 2010 Vodja projekta: Federiga Bindi Šifra: 134461-LLP-1-2007-1-IT-ERASMUS-ENW
Projekt ACUME – Kulturni spomin v evropskih državah: meddisciplinarni pristop Trajanje projekta: 1. januar 2003–31. oktober 2006 Vodja projekta: Vita Fortunati