Projekt Plemeniti meceni. Vloga in pomen aristokratskih naročnikov v sakralni umetnosti slovenskih dežel od 16. do 19. stoletja Trajanje projekta: 1. januar 2008–31. december 2010 Vodja projekta: dr. Blaž Resman
Projekt Standardi in menjalne vrednosti v evropskih prazgodovinskih družbah Trajanje projekta: 1. januar 2008–31. december 2009 Vodja projekta: Estelle Gauthier (Laboratoire de Chrono-Ecologie, UMR CNRS 6565) Šifra: BI-FR/08-09-PROTEUS-011
Projekt Izdelava in demonstracija modela za načrtovanje ohranjanja umetnostnozgodovinske dediščine v vojnih spopadih Trajanje projekta: 1. september 2007–30. november 2009 Vodja projekta: dr. Barbara Murovec
Projekt Zgodnje neagrarne naselbine kot prostor prenosa idej in znanja v srednjeveški Evropi Trajanje projekta: 1. januar 2007–31. december 2008 Vodja projekta: dr. Jiři Macháček
Projekt Računalniška arheološka podatkovna zbirka zgodnjesrednjeveških artefaktov Trajanje projekta: 1. maj 2006–30. april 2008 Vodja projekta: Prof. dddr. Andrej Pleterski
Projekt Razvoj slovenske kulturne krajine: primerjava rezultatov analize fitolitov in peloda Trajanje projekta: 1. januar 2003–31. december 2005 Vodja projekta: dr. Alexandra Golyeva Šifra: SLO-RUS 18/03/04
Projekt Umetnostna topografija Slovenije Trajanje projekta: 1. oktober 2006–30. september 2008 Vodja projekta: dr. Blaž Resman
Projekt Slovenska recepcija evropske kulture: Valvasorjeva grafična zbirka Trajanje projekta: 1. oktober 2006–30. september 2008 Vodja projekta: dr. Barbara Murovec
Projekt Ikonografske raziskave in vključitev slovenske umetnostne dediščine v informacijski sistem ICONCLASS Trajanje projekta: 1. julij 2007–31. december 2009 Vodja projekta: Dr. Ana Lavrič
Projekt Projekt PINE (Predicting Impacts on Natural Ecotones 2002-2005) Trajanje projekta: 1. maj 2002–30. april 2005 Vodja projekta: dr. S. Hicks - University of Oulu Šifra: EVK2-2001-00182