Projekt Folkloristične raziskave starejšega slovenskega ljudskega zvočnega izročila Trajanje projekta: 1. julij 2004–30. junij 2007 Šifra: L6-6106
Projekt Popisi začetnega stanja habitatnih tipov in ciljne vrste Loeslejeve grezovke (Liparis loeselli) ... na projektnih pilotnih območjih Zelenci, Planik, Vrhe... (Wetman 2011 - 2015, LIFE+NARAVA, LIFE09 NAT/SI/000374) Trajanje projekta: 25. maj 2011–31. januar 2013 Šifra: 8-IX-153/9-O-11/AS
Projekt Uporaba sledenj z naravnimi in umetnimi sledili pri načrtovanju zaščite kraških vod Trajanje projekta: 1. februar 2008–31. januar 2011 Šifra: L2-1152
Projekt Skupni sistem vrednotenja trajnostnosti upravljanja z vodnimi viri parkov Škocjanske jame in Risnjak Trajanje projekta: 1. januar 2014–17. junij 2015 Vodja projekta: Javni zavod Park Škocjanske jame
Projekt Vzpostavitev monitoringa izbranih ciljnih vrst mehkužcev Trajanje projekta: 25. september 2008–3. november 2009 Šifra: 2511-08-600155
Projekt GEP-Skupni geoinformacijski sistem (GIS) za varovanje virov pitne vode v izrednih dogodkih Trajanje projekta: 2. november 2011–30. oktober 2014
Projekt Neznani rokopisi slovenskega slovstva 17. in 18. stoletja: informacijsko-tehnološko podprta evidenca, znanstvene objave in analize Trajanje projekta: 1. februar 2008–30. januar 2011 Šifra: L6-0163 (B)
Projekt Uporniške preživetvene strategije na Slovenskem (16.–19. stoletje) Trajanje projekta: 1. julij 2011–30. junij 2014 Vodja projekta: dr. Darko Darovec Šifra: L6-4264 (C)
Projekt ACUME – Kulturni spomin v evropskih državah: meddisciplinarni pristop Trajanje projekta: 1. januar 2003–31. oktober 2006 Vodja projekta: Vita Fortunati