Projekt Srbi in Slovenci: migranti, manjšina, kolektivne identitete in spomini Trajanje projekta: 1. januar 2012–31. december 2013 Šifra: BI-RS/12-13-022
Projekt Pomen kulturne produkcije Slovencev v BiH in pripadnikov narodov BiH v Sloveniji Trajanje projekta: 1. januar 2014–31. december 2015 Šifra: BI-BA/14-15-004
Projekt Inventarizacija jamske in izvirske favne ter izdelava biospeleološke karte ter fitocenoloških popisov na Žumberaku in Gorjancih Trajanje projekta: 1. januar 2003–1. januar 2005 Šifra: 7/03-04 (SLO-HRV)
Projekt Biomineralizacija in izotopska sestava kisika in ogljika v hišicah nekaterih vrst sladkovodnih in kopenskih polžev v odvisnosti od ekoloških parametrov Trajanje projekta: 1. januar 2004–31. december 2005 Šifra: BI-HR/04-05-021
Projekt Zgodovina doktorskih disertacij slovenskih kandidatov v Avstro-ogrski monarhiji (1872–1918) Trajanje projekta: 1. januar 2016–31. december 2018 Vodja projekta: red. prof. dr. Tone Smolej Šifra: J7-7276 (B)
Projekt Novi izzivi slovenskih in hrvaških skupnosti v diaspori Trajanje projekta: 1. januar 2016–31. december 2017 Šifra: ARRS-BI-HR/16-17-011
Projekt Nacionalne literature, Srednja Evropa, Evropa in svet: metodološki problemi primerjalne literarne vede z vidika slovensko-čeških razmerij Trajanje projekta: 1. maj 2003–1. maj 2005 Vodja projekta: Ivo Pospíšil (Masarykova univerza, Brno) Šifra: BI-CZ/04-05-005
Projekt Literarna teorija in primerjalna književnost (problemi in rešitve v češki in slovenski tradiciji ter kontekstih) Trajanje projekta: 10. maj 2001–10. maj 2003 Vodja projekta: Ivo Pospíšil (Masarykova univerza, Brno) Šifra: SLO-ČEŠKI 29/01–03
Projekt Ideje o Evropi in evropeizaciji v primerjalni perspektivi: Slovenija in Srbija Trajanje projekta: 1. januar 2012–31. december 2013
Projekt Ekološke raziskave evropskih ogroženih vrst metuljev (Lepidoptera) v Sloveniji in na Madžarskem, s poudarkom na vrstah iz seznama NATURA 2000 Trajanje projekta: 3. januar 2005–20. december 2006