Projekt Nasilje nad ženskami ali kako doseči ničelno toleranco Trajanje projekta: 1. julij 2003–31. december 2003 Vodja projekta: dr. Majda Černič Istenič
Program Slovenski jezik v sinhronem in diahronem razvoju Trajanje programa: 1. januar 2004–31. december 2008 Vodja programa: dr. Helena Dobrovoljc Šifra: P6-0038 (B)
Projekt Digitalna enciklopedija dediščine Trajanje projekta: 1. julij 2009–30. september 2010 Vodja projekta: dr. Daniel Vladušič
Projekt Arheološke in palinološke raziskave na Ljubljanskem barju Trajanje projekta: 1. julij 2004–30. junij 2007 Vodja projekta: dr. Anton Velušček Šifra: J6-6348-0618-04
Projekt Izdelava in demonstracija modela za načrtovanje ohranjanja umetnostnozgodovinske dediščine v vojnih spopadih Trajanje projekta: 1. september 2007–30. november 2009 Vodja projekta: dr. Barbara Murovec
Projekt Umetnostna topografija Slovenije Trajanje projekta: 1. oktober 2006–30. september 2008 Vodja projekta: dr. Blaž Resman
Projekt Slovenska recepcija evropske kulture: Valvasorjeva grafična zbirka Trajanje projekta: 1. oktober 2006–30. september 2008 Vodja projekta: dr. Barbara Murovec
Projekt Konstruiranje pajčje mreže preko madagaskarskih rek: nenavadna pajčevina gigantskih mrež Trajanje projekta: 1. januar 2009–31. december 2010 Šifra: 8655-09
Projekt Upravljanje z migracijami in njihovimi učinki v Jugovzhodni Evropi: transnacionalni ukrepi, ki vodijo k na podatkih temelječim strategijam Trajanje projekta: 1. junij 2012–30. november 2014 Vodja projekta: dr. Attila Melegh
Projekt Vrednotenje Skupnega ukrepa EU “Duševno zdravje in dobro počutje” Trajanje projekta: 1. februar 2013–30. marec 2016 Vodja projekta: José Miguel Caldas de Almeida