Projekt Razvoj slovenske kulturne krajine: primerjava rezultatov analize fitolitov in peloda Trajanje projekta: 1. januar 2003–31. december 2005 Vodja projekta: dr. Alexandra Golyeva Šifra: SLO-RUS 18/03/04
Projekt Rekonstrukcija paleookolja s pomočjo analize rastlinskih in živalskih mikrofosilov v kulturnih plasteh slovenskih arheoloških najdišč Trajanje projekta: 1. januar 2005–31. december 2007 Vodja projekta: Alexandra Golyeva Šifra: BI-RU/05-07-012
Program Rodnostno vedenje prebivalcev Slovenije Trajanje programa: 1. januar 1999–31. december 2003 Vodja programa: dr. Majda Černič Istenič Šifra: P0-0524-0618 (B)
Projekt ModeLTER - Evropski laboratorij za modeliranje pokrajin in prostorov Trajanje projekta: 1. februar 2007–30. november 2011 Vodja projekta: izr. prof. dr. Krištof Oštir in dr. Laure Nuninger, Univerza Franche-Comté
Projekt Materialna kulturna dediščina v slovenskih narečjih: geolingvistična predstavitev Trajanje projekta: 1. julij 2011–31. december 2015 Šifra: L6-4042
Program Slovenski jezik v sinhronem in diahronem razvoju Trajanje programa: 1. januar 2009–31. december 2014 Šifra: P6-0038
Projekt Neglected Holocaust: Remembering the Deportation of the Jews in Slovenia Trajanje projekta: 1. julij 2010–30. junij 2012
Projekt Slovenski kulturniki in izobraženci na Hrvaškem od 1860-1918 Trajanje projekta: 1. maj 2002–1. maj 2003
Projekt Standardizirano elektronsko kodiranje in mapiranje služb za dolgotrajno oskrbo Trajanje projekta: 1. julij 2008–31. januar 2011 Vodja projekta: dr. Luis Salvador Carulla