Projekt Soška fronta – geografija Trajanje projekta: 1. junij 2006–31. maj 2008 Vodja projekta: dr. Petra Svoljšak
Program Geografski terminološki slovar Trajanje programa: 1. januar 2003–31. december 2005 Vodja programa: dr. Franc Lovrenčak
Projekt Preobrazba pokrajine Trajanje projekta: 1. oktober 2006–30. april 2008 Vodja projekta: dr. Lučka Ažman Momirski
Projekt ModeLTER - Evropski laboratorij za modeliranje pokrajin in prostorov Trajanje projekta: 1. februar 2007–30. november 2011 Vodja projekta: izr. prof. dr. Krištof Oštir in dr. Laure Nuninger, Univerza Franche-Comté
Projekt Korak k trajni ohranitvi biodiverzitete: primer favne pajkov Švice in Slovenije Trajanje projekta: 1. januar 2011–31. december 2012 Šifra: CONS-SPIDERS
Projekt Regionalna primerjava spreminjanja poselitvene rabe zemljišč med statističnimi regijami v Sloveniji v obdobju 1991-2002 Trajanje projekta: 1. november 2003–31. oktober 2005 Šifra: CRP V5-0903
Projekt Prva svetovna vojna: zgodovinski spomin in opomin Trajanje projekta: 1. januar 2013–31. december 2014
Program Raziskovanje krasa Trajanje programa: 1. januar 2009–31. december 2014 Vodja programa: dr. Tadej Slabe Šifra: P6-0119
Projekt SILIS - Satelitski posnetki za slovenski prostorski informacijski sistem Trajanje projekta: 15. april 2015–14. april 2017 Vodja projekta: dr. Žiga Kokalj