Projekt PROGRAM: Arheološke raziskave (2004–2008) Trajanje projekta: 1. januar 2004–3. december 2008 Vodja projekta: dr. Slavko Ciglenečki Šifra: P6-0064
Projekt Vzorci prilagajanja človekovih dejavnosti spremembam v okolju po zadnjem glacialnem maksimumu v Sloveniji Trajanje projekta: 1. julij 2011–30. junij 2014 Vodja projekta: dr. Dušan Plut (Filozofska fakulteta Univerze v Ljubljani) Šifra: J6-4016
Projekt ISOMEX. Rekonstrukcija (nekdanje) izotopske sestave padavin v Sredozemlju s pomočjo analize treh paleoklimatskih arhivov: drevesnih branik, stalagmitov in jezerskih sedimentov Trajanje projekta: 1. januar 2011–31. december 2013 Vodja projekta: dr. Dominique Genty
Program Raziskave slovenske glasbene preteklosti Trajanje programa: 1. januar 2009–31. december 2014 Vodja programa: dr. Jurij Snoj Šifra: P6-0004
Program Rodnostno vedenje prebivalcev Slovenije Trajanje programa: 1. januar 1999–31. december 2003 Vodja programa: dr. Majda Černič Istenič Šifra: P0-0524-0618 (B)
Projekt Standardizirano elektronsko kodiranje in mapiranje služb za dolgotrajno oskrbo Trajanje projekta: 1. julij 2008–31. januar 2011 Vodja projekta: dr. Luis Salvador Carulla
Program Literarnozgodovinske, literarnoteoretične in metodološke raziskave Trajanje programa: 1. januar 2009–31. december 2014 Vodja programa: dr. Marko Juvan Šifra: P6–0024 (B)
Projekt Ocena stanja populacij in habitatov ter predlog monitoringa za ogrožene vrste barjanski okarček (Coenonympha oedippus), močvirski tulipan (Fritillaria meleagris) in Loeselova grezovka (Liparis loeselii) na Ljubljanskem barju Trajanje projekta: 15. maj 2008–30. oktober 2009
Projekt Razvoj slovenske kulturne krajine: primerjava rezultatov analize fitolitov in peloda Trajanje projekta: 1. januar 2003–31. december 2005 Vodja projekta: dr. Alexandra Golyeva Šifra: SLO-RUS 18/03/04
Program Vključevanje pravnega izrazja evropskega prava v slovenski pravni sistem Trajanje programa: 1. januar 2004–31. december 2017 Vodja programa: Dr. Grega Strban Šifra: P5-0217